几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具 - 分子模拟 …
2023年10月15日 · 用户只需要输入氨基酸序列，比如RLCVVPIRLPPLRERT，并且指定要产生的二级结构的phi、psi、omega角度，就可以获得结构文件。 能产生的格式很多，包括符合IUPAC命名规范的pdb文件。
SWISS-MODEL
Nucleic Acids Res 45, D313-D319. (2017) 27899672 10.1093/nar/gkw1132. Guex N, Peitsch MC, Schwede T . Automated comparative protein structure modeling with SWISS-MODEL and Swiss-PdbViewer: A historical perspective. Electrophoresis 30, S162-S173. (2009) 19517507 10.1002/elps.200900140.
ChemBioOffice下载 v21.0.0 电脑版 - 开心电玩
2023年10月1日 · ChemOffice也提供了常用氨基酸的模版。 在工具栏上右键——“Templates”——“Amino Acid”或“Amino Acid Slide Chains” 其他的模版请自行测试学习
SWISS-MODEL Interactive Workspace - Expasy
When a protein amino acid sequence is pasted into the textarea, the input text is immediately validated and if valid replaced with an interactive sequence view. The format of the sequence must be either FASTA, Clustal or raw sequence. You may also upload the sequence as a file. As an example, we will paste the sequence:
几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具 - 思想家公 …
2023年10月15日 · 用户只需要输入氨基酸序列，比如RLCVVPIRLPPLRERT，并且指定要产生的二级结构的phi、psi、omega角度，就可以获得结构文件。 能产生的格式很多，包括符合IUPAC命名规范的pdb文件。
AlphaFold Protein Structure Database
AlphaFold is an AI system developed by Google DeepMind that predicts a protein’s 3D structure from its amino acid sequence. It regularly achieves accuracy competitive with experiment.
ESM‐scan — 一种指导氨基酸替换的工具,Protein Science - X-MOL
2024年11月20日 · 我们的实验结果表明，ESM-zero shot 模型能够推断一组氨基酸取代对预测适应性与实验结果之间相关性的影响。ESM‐Scan 在 https://huggingface.co/spaces/thaidaev/zsp 上公开提供。 "点击查看英文标题和摘要"
带你一起认识ChemDraw Professional 15的模板工具（一）
2016年1月27日 · 4、Animal（动物工具）：该模板提供多种有色动物形象工具，方便绘制反应关系或添加解释说明，动物模板中有兔子、猴子、鸡、羊、大象、狗等。 动物工具
教您用ChemDraw绘制蛋白质化学结构图 - ChemDraw中文网
2020年2月28日 · 甘氨酸是最简单的蛋白质，所以其中心依然有个C原子。首先需要输入这个C原子，方法是直接打开ChemDraw化学绘图软件，在左边的图标编辑栏中找到Text tool，也就是文字工具，然后输入一个c即可。 图 2：编辑C原子. 第三步：选择模板
ESM-Scan - 指导氨基酸取代的工具,bioRxiv - Biochemistry - X-MOL
2023年12月12日 · 我们使用三个公开可用的数据集对 ESM-Scan 的序列变化稳定性和功能性预测能力进行基准测试，并通过实验评估该工具在来自甲基橙属物种 (MsLadC) 的蓝光激活二鸟苷酸环化酶的挑战性测试案例中的性能。